镇江市经济开发区检察院由原镇江市大港地区检察院和镇江市丁卯桥地区检察院于2002年6月合并成立，座落在镇江新区金港大道90号。全院内设办公室、侦查监督公诉科、职务犯罪侦查局、控申民行检察科四个科（局、室）。

近年以来，镇江市经济开发区人民检察院在市检察院党组和新区党工委的坚强领导下，始终坚持“建设钢班子，打造铁队伍”的思路，和“立足检察、创新创特、紧贴新区、服务发展”的工作理念，不断推动检察工作创新发展，为新区经济社会发展提供公正、高效、优质的法律服务，各项检察工作都取得了明显的成效。建成了全国检察机关中首个知识产权维权援助分中心，设立了知识产权保护工作站，开通了知识产权维权热线电话，创办了《知识产权》专刊，开设了知识产权网站，知识产权保护工作取得显著成效，得到省检察院检察长徐安的批示肯定。在全市率先建成了对涉罪外来人员和未成年人的阳光观护基地，得到了前来视察的全国、省、市人大代表的赞扬。在全省率先建立远程视频接待中心，妥善化解了一大批社会矛盾。建立了预防职务犯罪人民防线，形成了社会立体化预防职务犯罪网络新格局。加强文化园地建设，建成了占地1万平方米的文化广场和250平方米的文化教育基地，建立了检察文化墙和检察文化长廊，形成了具有开发区检察特色的文化内涵，累计接待党员干部学习参观6000余人次，检察文化经验做法，先后被检察日报、江苏法制报在头版显要位置刊登。

全院先后荣获江苏省公正司法示范点、“江苏省优秀青少年维权岗”、“江苏省预防青少年违法犯罪工作先进集体”、“江苏省检察机关文明接待室”、“江苏省青年文明号”、“江苏省文明单位”、“江苏省特一级档案室”、“江苏省五星级档案室”、全省检察机关“严格规范执法，确保司法公正”先进集体、“镇江市社会治安综合治理先进集体”、“镇江市十佳规范执法示范单位”、“镇江市先进检察院”、“新区服务创优先进集体”、“新区法治建设先进集体”等93项省、市、区集体荣誉，干警189人次被最高人民检察院通令嘉奖，并获得江苏省十佳女检察官、江苏省三八红旗手、全省检察机关十佳“侦查监督办案能手”、 全省反渎侦查办案业务标兵、全省政法宣传先进个人、“全市检察机关十佳检察官”、“全市检察机关十佳公诉人”、“镇江市百佳文明市民”等各级各类表彰。